В моем configure стояла опция -skip qtdeclarative, это как раз то, что исключало qml из сборки))
Вспоминаю, поставил ее потому, что на raspberry pi этот модуль не собирался, если сборку делать с распараллеливанием задач: make -j4. Малина начинала тормозить, греться, а потом сборка прерывалась. Собрал просто - make.