Наверное многое зависит от аппаратуры. QGLWidget должен использовать аппаратное ускорение, а QPainter скорее всего не будет. Хотя вроде как в Qt4 новая система рисования.
Можешь выложить результаты сравнения? (только напиши версию Qt, ОС, параметры hardware). Если выложишь исходники - проверю у себя на Fedora Core 3.
Ага щас тока допишу тест для OpenGL