Советую пойти на gamedev.ru и немного поизучать основы сего проектирования. Для начала ты должен четко представлять, за что отвечает клиент, а за что - сервер, и от этого получить какие данные должны синхронизироваться, а какие - нет.

Самое простое: каждый раз при обновлении серверной информации, сервер посылает клиенту состояние всех динамических точек в видимой локации. На основе этих данных клиент отображает мир.
клиент в свою очередь посылает данные об изменении своих динамических точек, начиная анимацию и т.п., которая подстраивается по мере реакции сервера (в правильно организованном приложении рывков не будет при синхронизации)

а почему этого нельзя делать через сам клиент? Флеш-клиент и должен подлогиниваться к серваку и т.п. Это вообще дело того, кто клиент и пишет. Сайт здесь не нужен, т.к. каким местом он тут привязывается то?

Юзверь открывает страницу с флешкой, флешка коннектится к серваку, и все. Чаще всего флешка лежит на том же серваке, что и сервак, простите за тавтологию

для обычной игры - ничего не, конечно можно сварганить целый сайт для осуществления игровых дейсвтий, к примеру, купля/продажа и т.п., но это для игр для аудитории побольше катит