Жалко ответов не получил здесь, но с помощью LOR был предложен способ полной конвертации
базы с cp1251 в utf8 , что помогло на все 100%. хотя хотелось бы конвертнуть программно, но и так пойдет пока!
sqlite3 mydb.db ".dump" | iconv -f cp1251 -t utf8 > dump.sql
sqlite3 mydb-utf.db ".read dump.sql"