2 ddenis, я работаю через bat'ник:
set QTDIR=H:\Qt\4.6.S_shared
set MINGWDIR=F:\MinGW\3.4.5
set QMAKESPEC=win32-g++
set QTBIN=%QTDIR%\bin
set MINGWBIN=%MINGWDIR%\bin
::===================================
set ADDONPATH=F:\svn\bin
::F:\cygwin\bin; F:\GnuWin32\bin
::===================================
set PATH=%QTBIN%;%MINGWBIN%;%ADDONPATH%;%SystemRoot%\System32
F:\totalcmd\TOTALCMD.EXE
т.е. запускаю Тотал в определенном окружении. (сейчас к нему ещё путь к perl.exe указал)