А что именно можна туда записывать, тоесть какие переменные
Во фре начиная с 5-й ветки широко используется система rc.subr. И вот тут и пригождается файлик rc.conf.local - в него записываешься разрешения на запуск установленных тобой демонов, например для веб-сервера апач apache_enable="YES". Если же ты такую запись не сделаешь то при попытке запуска демона рц.скриптом напрмиер из папки /usr/local/etc/rc.d/<demon> start - ничего происходить не будет.
Ну а с rc.conf все ещё проще - как и сказалы выше это файл для кастомизации системы - что в него можно писать смотри в /etc/defaults/rc.conf
