У меня в config нет stl. Все работает. Ничего не пересобирал, как поставил, так и хорошо.
[qt-win-opensource-4.3.3-mingw]
[eclipse-cpp-europa-fall2-win32]
[qt-eclipse-integration-win32-1.0.1]
в CONFIG написано release, warn_on, designer, plugin.
из неqtшных включены хидеры "windows.h" и <iostream>
вставляю в код строки
std::string st = str.toStdString();
std::cerr << st << "\n";
все компилится, текст выводится