У Eclipse есть свой парсер бинарных файлов (зачем?). Для того, что бы все заработало надо зайти Project->Properties->C/C++ Make Project->Binary Parser и сказать “сюрпрайз, мы не в Linux!!!”
Что касается CodeBlocks, то я попробовал эту штука. После Visual Studio 2005 абсолютно не возбудило!!! А вот Eclipse, на мой взгляд, даже более мощная штукенция, чем vs. Однако достаточно тормознутая (после того же vs), жаба не дает о себе забыть!
P.S. Какой инструмент можно использовать в Eclipse для контроля утечек памяти?