Я хочу сделать, чтобы при перемещении строки с помощью Drag and Drop в QAbstractTableModel изменялся список, на котором основывается модель, в соответствии с изменением модели.
А разве сейчас модель не обновляется?
Через ф-ю mimeData запихнуть номера перемещаемых строк в QMimeData, а в dropMimeData вытащить их оттуда и анализировать как Вы хотите.
Так теряется весь сервис Qt, у них mime заточено на DnD между приложениями
А вообще я так и не смог добиться разумного перемещения, см
здесь