Возможна проблема с путями. Попробуйте указать абсолютный путь.
Вторая наиболее частая проблема - привилегии.
Третья - неправильный/занятый другой программой qm файл
Спасибо, с путями был все хорошо, перегенерил ts и qm файлы и добавил пару переводов, все ок стало. Ситуация вероятно получилась либо из за того что собираю на 5.2 а генерировал на 5.4, либо из за того что в ts файле не было ни одного перевода