Запустить программу, которая пошлёт всем батникам нажатие клавиши.
Как вариант берём ОС Windows 7. Если у батника имеется неограниченный доступ, можно тупо выдать серверу сценариев java скрипт с необходимым функционалом.
В результативности данного подхода не уверен, но возможность есть.
PS может рубится уже системой, ибо это заманчивая мысль для вирусни