Т. е. вы хотите, чтобы приложение, написанное на неведомом языке, интегрировалось в вашу программу? Милорд, вы устанете код писать и рак на горе сдохнет от старости, когда ваша программа начнёт всё поддерживать. Добавьте ещё запреты на запуск программ в окнах/программные полноэкранные режимы (вот тут хз - тёмный лес).
Чтобы приложение работало "В" вашей программе, необходимо перехватывать "ВСЕ" его евенты, передавать ему "ВСЕ" события, принимать от него "ВСЕ" его события и отдавать системе. Так же необходимо перехватывать все его системные вызовы как бэ.
При чём половина из перечисленного мной будет воспринято антивирусом как некошерное поведение.
Конечно же вы не указали операционку (по разумению - windows). Что сказать в общем - вам нужна виртуальная машина, получается
