Была и такая попытка. Добавлял путь "C:\QtSDK\Desktop\Qt\4.7.3\mingw\include", размер генерируемой документации сразу вырастает до 150 Мб.
Судя по наличию такой настройки:
ALLEXTERNALS
If the ALLEXTERNALS tag is set to YES all external class will be listed in the class index. If set to NO only the inherited external classes will be listed.
думаю все-таки есть возможность задать путь к Qt именно как
внешней библиотеке, которую не надо полностью документировать. Остается только найти, где это сделать...