Нет, после stop() больше ни одна процедура не запускается.
Возможно это здесь:
void MyService::stop()
{
delete dMain;
srgLogServer->deleteLater();
}
srgLogServer - обявлен поза классом. И dMain широко его использует (отправляет и принимает сигналы). Возможно после удаления dMain, он еще пытается какой-то лог на него отправить.